Käsitykset autistisuuden ja mielenterveyshäiriöiden suhteesta ovat vaihdelleet eri aikoina. Autistinen henkilö saattaa esim. käyttäytyä persoonallisuushäiriöisen tavalla, mutta käytös selittyy autismilla. Toisaalta autistilla voi olla mielenterveysongelmia.